黄飞鸿应国际医学会的邀请，与梁宽、少筠前往广州，因缘际会结识孙文和陆皓东。白莲教利用神佛之说，宣扬神功刀枪不入，扶清灭洋，火烧西洋学校，黄飞鸿不满白莲教残害无辜出手相救，更替学生四处奔走，后来得到陆皓东的帮助，寄居英国领事馆。满清提督纳兰元述为了对付里头窝藏的革命党人，不惜协助白莲教围攻领事馆，孙文早已先行脱逃，黄飞鸿与乔装弟子的陆皓东以阻止白莲教教徒肆虐为由、脱离纳兰元述掌握，直捣朝天观击败九宫真人，揭破神功秘密。在护送陆皓东回头取革命党员名册时，遇上纳兰元述的追捕，陆皓东伤重不治，黄飞鸿遂与其展开生死战。